MiSeq のサイクル数延長の研究
300サイクル用のイルミナ社のMiSeq試薬で何サイクルまで反応可能かを試してみる。
公称では「325サイクルまで可能」となっている。
まずは、332サイクル(158+8+8+158)。
データクオリティは良し(↑)。
試薬の残存量は、一番奥側の4の試薬が一番少なくなっているものの(↑)、まだいけそう。
4サイクル追加して、336サイクル(160+8+8+160)。
今回もデータクオリティは良し(↑)。
しかし、またも4の試薬が一番少なくなっている(↑)。
結論:300サイクルキットでは少なくとも合計336サイクルは可能。
リード1でもリード2でも最後のベースのクオリティが下がるのはサイクル数に依らないようである。
あと2サイクルぐらいは伸ばせそうなので、次回は338サイクル(161+8+8+161)に挑戦!