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任期付き助教は、任期付き羊の夢をみるか?

任期制を導入した人たちは、任期付き羊の夢など見ないだろう。

MiSeq

Methods in Next Generation Sequencing 誌が休刊

オンラインジャーナルのブームにのり登場したMethods in Next Generation Sequencing 誌が、論文原稿の受付を取り止めた。2012年に始まり、これまで2巻までしか出ていなかった…。雑誌名が良かっただけに残念…。世界的なジャーナル乱立時期に生き残るには、容…

お勧めシークエンシングデータ用オンラインストレージ 2016年度版

シークエンシングデータは巨大化を続けている。 小規模な研究室ではデータの解析方法に加えて、データの保存方法も問題になることが多い。 自前の保存デバイスを持たずに、オンラインストレージにアウトソーシングするのも一つの手だ。 現在は沢山の企業によ…

シークエンサーのコンピュータが実はスゴい

ショーンK事件とアップル新製品発表の記事が続いてしまって、久々となるシークエンスの話題。 高性能なコンピュータが無ければNGSのデータ解析は出来ないと思われがちだが、市販のコンピュータでも目的によってはかなり対応できる。 例えばMiSeqでの数百メガ…

MiniSeqがヒットしないと思う理由の補足

昨日の記事の補足。 HiSeq(約1億円)を買えない人達に MiSeq(現在約1200万円)と言うのは分かる。 HiSeq(約1億円)を買えない人達に NextSeq(約3000万円)と言うのも分かる。 しかし、MiSeq(約1200万円)を買えない人達にMiniSeq(約600万円)と言うのはビジネスと…

MiniSeq がヒットしないと思う5つの理由

イルミナのMiniSeqの発売を記念して、コンペティションが行われている。 MiniSeq の使い方で最も優れた研究アイデアを提案した人には、MiniSeqと乗用車のMiniがプレゼントされるというのだ。 …一体、どういう層をターゲットにしているのだろうか? 「あー、…

MiSeq のサイクル数延長の研究

300サイクル用のイルミナ社のMiSeq試薬で何サイクルまで反応可能かを試してみる。 公称では「325サイクルまで可能」となっている。 まずは、332サイクル(158+8+8+158)。 データクオリティは良し(↑)。 試薬の残存量は、一番奥側の4の試薬が一番少なくなって…